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What?“垃圾DNA”

閱讀次數:760   發布時(shi)間:2019/1/25 11:25:01

為什么在您的科研中使用“假基因”的三個理由:
蛋白(bai)質編(bian)碼DNA或(huo)“功(gong)能(neng)(neng)”基(ji)(ji)因在(zai)(zai)人類基(ji)(ji)因組(zu)中(zhong)(zhong)僅占(zhan)2%。 至(zhi)今,其(qi)(qi)余(yu)98%因共非(fei)編(bian)碼特征而被稱為(wei)“垃(la)圾DNA”。 這(zhe)個名字本身就意味(wei)著垃(la)圾DNA是(shi)無用的(de),可(ke)以忽略。 然而,進(jin)一步的(de)研究表(biao)明,實際(ji)上垃(la)圾DNA可(ke)能(neng)(neng)對(dui)我們(men)的(de)基(ji)(ji)因組(zu)的(de)功(gong)能(neng)(neng)至(zhi)關(guan)重(zhong)要。 例(li)如,有(you)沒有(you)想過(guo)為(wei)什么人星形膠質細(xi)胞和肝(gan)細(xi)胞來源于同(tong)一受精卵(luan),并且攜(xie)帶完全(quan)相同(tong)的(de)遺傳信息,但它們(men)的(de)發育,形態和功(gong)能(neng)(neng)差別(bie)很大? 雖然部分原(yuan)因在(zai)(zai)于表(biao)觀遺傳學,其(qi)(qi)中(zhong)(zhong)基(ji)(ji)因表(biao)達受表(biao)觀遺傳修飾如DNA甲(jia)基(ji)(ji)化調控,但一些研究人員(yuan)也在(zai)(zai)尋找所謂(wei)的(de)“垃(la)圾DNA”中(zhong)(zhong)的(de)線(xian)索(suo)。 結果發現了(le)“假(jia)基(ji)(ji)因”,并揭示了(le)它們(men)維持(chi)正常細(xi)胞生(sheng)物學的(de)多種(zhong)作(zuo)用。

顯然,“假(jia)基(ji)因(yin)”是與其相(xiang)應的(de)功能(neng)基(ji)因(yin)具有高序列(lie)相(xiang)似(si)性的(de)DNA片段(duan),但已失去其部分或全(quan)部功能(neng)。與功能(neng)基(ji)因(yin)研究(jiu)的(de)相(xiang)比,“假(jia)基(ji)因(yin)”研究(jiu)還(huan)處于(yu)起(qi)步階(jie)段(duan)。 不過,您(nin)有理由(you)認(ren)真對(dui)待您(nin)的(de)研究(jiu)中的(de)“假(jia)基(ji)因(yin)”。

 1. “假(jia)基因(yin)”的(de)出現比想(xiang)象中(zhong)更常見、更重要

現在我們普遍(bian)認(ren)為(wei),在人類基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)組中,“假基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”的(de)數目(mu)至(zhi)(zhi)少與(yu)蛋白質編碼的(de)“功能(neng)(neng)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”的(de)數量(liang)相(xiang)(xiang)當。許多(duo)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin),甚至(zhi)(zhi)是(shi)您的(de)感興趣的(de)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin),都有一個或多(duo)個相(xiang)(xiang)應(ying)的(de)“假基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”。 雖然仍然被認(ren)為(wei)是(shi)垃圾DNA,但是(shi)很多(duo)“假基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”都得到(dao)轉(zhuan)錄,有些(xie)甚至(zhi)(zhi)被翻(fan)譯。證據(ju)表明,一些(xie)“假基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”的(de)轉(zhuan)錄水平是(shi)至(zhi)(zhi)關重要的(de),“假基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)”的(de)失調可能(neng)(neng)誘發各(ge)種疾病和病癥(zheng)的(de)發病機制。

 2. “假基因(yin)”可能(neng)影(ying)響功能(neng)基因(yin)的(de)表達。

如您所知,基(ji)(ji)因(yin)轉錄水(shui)平在正常細胞(bao)代謝的(de)許多(duo)方面起決定性(xing)作用(yong),并通過復雜的(de)網絡進行嚴格調控(kong)。“假(jia)(jia)基(ji)(ji)因(yin)”也可以在這個調節(jie)中發揮作用(yong)。許多(duo)“假(jia)(jia)基(ji)(ji)因(yin)”由基(ji)(ji)因(yin)的(de)重復事件產(chan)生,因(yin)此與相應的(de)功能基(ji)(ji)因(yin)序列(lie)有(you)高度相似(si)(si)性(xing)。因(yin)此,當(dang)“假(jia)(jia)基(ji)(ji)因(yin)”被轉錄時(shi),它們(men)與功能基(ji)(ji)因(yin)相似(si)(si)的(de)mRNA可以作為(wei)競爭的(de)內源性(xing)RNA(ceRNA)來(lai)調節(jie)相應功能基(ji)(ji)因(yin)的(de)表達水(shui)平。

 3. 不(bu)能(neng)將“假基(ji)(ji)因”的轉錄水平與其相應的功(gong)能(neng)基(ji)(ji)因區分(fen)開來,可能(neng)會造成研究數據的假象。

雖然序列(lie)高(gao)度相(xiang)似,“假(jia)基因”和相(xiang)應(ying)的(de)(de)(de)功能基因在細(xi)胞生(sheng)物(wu)學中顯然起不(bu)(bu)同的(de)(de)(de)作用,并通過(guo)不(bu)(bu)同的(de)(de)(de)機制(zhi)進(jin)行調控。 分別分析是(shi)(shi)獲取正確結(jie)論(lun)的(de)(de)(de)先決條件。 以(yi)其高(gao)度序列(lie)相(xiang)似性,通過(guo)qPCR分開它們(men)是(shi)(shi)不(bu)(bu)容(rong)易的(de)(de)(de)。 必須仔細(xi)設計引物(wu),以(yi)確保(bao)不(bu)(bu)僅PCR高(gao)效(xiao)率,而(er)且還可(ke)以(yi)確保(bao)“假(jia)基因”或功能基因的(de)(de)(de)特(te)異性。許多時候,兩者之間(jian)的(de)(de)(de)差異只(zhi)是(shi)(shi)幾個核苷酸(suan),需要專(zhuan)業知識才能成功進(jin)行qPCR分析。 區別較小的(de)(de)(de)qPCR引物(wu)可(ke)能導致不(bu)(bu)可(ke)靠甚至錯誤的(de)(de)(de)結(jie)論(lun)。

ScienCell研究實驗室(shi)開發了世界上個(ge)假(jia)基(ji)因(yin)轉錄分析qPCR試劑盒,以更好(hao)地幫(bang)助您(nin)分析假(jia)基(ji)因(yin)轉錄及(ji)其對功能(neng)基(ji)因(yin)表(biao)達(da)的(de)影響。我(wo)們的(de)試劑盒保證每個(ge)引物組僅(jin)擴增(zeng)(zeng)指定的(de)基(ji)因(yin)或假(jia)基(ji)因(yin)而(er)不進行交(jiao)叉擴增(zeng)(zeng)。無論(lun)您(nin)是(shi)否已經考(kao)慮到(dao)假(jia)基(ji)因(yin),或者只(zhi)是(shi)在(zai)今天學習假(jia)基(ji)因(yin),我(wo)們都向您(nin)伸出援(yuan)助之手。我(wo)們的(de)科學家將幫(bang)助確定與(yu)您(nin)的(de)研究相關的(de)假(jia)基(ji)因(yin)和評估它們的(de)*jia方式(shi)。

 

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